Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN8Q9UBY8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLN8Q9UBY8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLN8Q9UBY8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN8Q9UBY8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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