Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms