Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAPERQ9BY12 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms