Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms