Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms