Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2BQ99453 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms