Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NXPE2Q96DL1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms