Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf17Q53FE4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms