Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP6Q16828 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP6Q16828 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms