Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEC23BQ15437 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEC23BQ15437 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms