Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRKQ15262 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
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