Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
RAPSNQ13702 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAPSNQ13702 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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