Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AC020656.1-201ENST00000548900 599 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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MKRN4PQ13434 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
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