Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACACAQ13085 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACACAQ13085 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms