Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF2Q12933 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF2Q12933 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms