Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A3Q01959 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms