Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMF1P82094 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMF1P82094 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMF1P82094 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMF1P82094 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMF1P82094 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMF1P82094 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMF1P82094 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMF1P82094 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMF1P82094 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMF1P82094 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMF1P82094 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMF1P82094 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMF1P82094 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMF1P82094 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMF1P82094 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMF1P82094 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMF1P82094 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMF1P82094 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMF1P82094 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMF1P82094 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMF1P82094 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMF1P82094 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMF1P82094 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMF1P82094 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMF1P82094 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMF1P82094 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMF1P82094 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMF1P82094 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMF1P82094 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMF1P82094 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMF1P82094 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMF1P82094 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMF1P82094 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms