Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113P62684 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms