Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3AP31941 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3AP31941 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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