Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSFA2P28290 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms