Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALB2P22676 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALB2P22676 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALB2P22676 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALB2P22676 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALB2P22676 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CALB2P22676 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALB2P22676 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALB2P22676 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALB2P22676 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALB2P22676 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALB2P22676 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALB2P22676 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALB2P22676 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALB2P22676 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALB2P22676 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALB2P22676 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALB2P22676 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALB2P22676 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALB2P22676 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALB2P22676 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALB2P22676 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALB2P22676 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALB2P22676 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALB2P22676 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALB2P22676 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALB2P22676 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALB2P22676 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALB2P22676 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALB2P22676 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALB2P22676 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALB2P22676 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALB2P22676 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALB2P22676 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms