Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DMDP11532 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DMDP11532 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DMDP11532 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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