Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCNDBP1O95273 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNDBP1O95273 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms