Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PROM1O43490 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PROM1O43490 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROM1O43490 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROM1O43490 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROM1O43490 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROM1O43490 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROM1O43490 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROM1O43490 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROM1O43490 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROM1O43490 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROM1O43490 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROM1O43490 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PROM1O43490 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PROM1O43490 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PROM1O43490 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms