Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRRTM2O43300 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms