Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp2Q9Z0E6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp2Q9Z0E6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbp2Q9Z0E6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp2Q9Z0E6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp2Q9Z0E6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp2Q9Z0E6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp2Q9Z0E6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp2Q9Z0E6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp2Q9Z0E6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp2Q9Z0E6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp2Q9Z0E6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp2Q9Z0E6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp2Q9Z0E6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp2Q9Z0E6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms