Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc6Q9R087 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpc6Q9R087 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpc6Q9R087 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms