Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan4Q9DCK3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan4Q9DCK3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms