Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFT27Q9BW83 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFT27Q9BW83 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT27Q9BW83 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms