Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPS4Q9BT78 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
COPS4Q9BT78 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS4Q9BT78 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS4Q9BT78 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms