Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZNF397Q8NF99 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF397Q8NF99 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF397Q8NF99 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF397Q8NF99 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms