Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ckap2lQ7TS74 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ckap2lQ7TS74 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ckap2lQ7TS74 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms