Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBRG1Q3YBR2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBRG1Q3YBR2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBRG1Q3YBR2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBRG1Q3YBR2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms