Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HERC3Q15034 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC3Q15034 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
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