Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 RRP46YGR095C 672 nt5.5□□□□□ -1.53
USB1Q12208 TSR2YLR435W 618 nt5.5□□□□□ -1.53
USB1Q12208 YNL017CYNL017C 339 nt5.5□□□□□ -1.53
USB1Q12208 YBR027CYBR027C 333 nt5.5□□□□□ -1.53
USB1Q12208 PPT1YGR123C 1542 nt5.49□□□□□ -1.53
USB1Q12208 GPD2YOL059W 1323 nt5.48□□□□□ -1.53
USB1Q12208 GUF1YLR289W 1938 nt5.48□□□□□ -1.53
USB1Q12208 CHS5YLR330W 2016 nt5.48□□□□□ -1.53
USB1Q12208 RSC2YLR357W 2670 nt5.48□□□□□ -1.53
USB1Q12208 YKR045CYKR045C 552 nt5.48□□□□□ -1.53
USB1Q12208 SRL2YLR082C 1179 nt5.48□□□□□ -1.53
USB1Q12208 PDR18YNR070W 4002 nt5.47□□□□□ -1.53
USB1Q12208 YPR204WYPR204W 3099 nt5.47□□□□□ -1.53
USB1Q12208 YEL020CYEL020C 1683 nt5.47□□□□□ -1.53
USB1Q12208 GAL83YER027C 1254 nt5.47□□□□□ -1.53
USB1Q12208 TFG2YGR005C 1203 nt5.47□□□□□ -1.53
USB1Q12208 DMA1YHR115C 1251 nt5.47□□□□□ -1.53
USB1Q12208 CCP1YKR066C 1086 nt5.47□□□□□ -1.53
USB1Q12208 GTO3YMR251W 1101 nt5.47□□□□□ -1.53
USB1Q12208 PTC3YBL056W 1407 nt5.47□□□□□ -1.53
USB1Q12208 HEM2YGL040C 1029 nt5.46□□□□□ -1.54
USB1Q12208 LCB3YJL134W 1230 nt5.46□□□□□ -1.54
USB1Q12208 QCR8YJL166W 285 nt5.46□□□□□ -1.54
USB1Q12208 CDC11YJR076C 1248 nt5.46□□□□□ -1.54
USB1Q12208 YJR084WYJR084W 1272 nt5.46□□□□□ -1.54
USB1Q12208 POP5YAL033W 522 nt5.46□□□□□ -1.54
USB1Q12208 DRE2YKR071C 1047 nt5.46□□□□□ -1.54
USB1Q12208 PTC4YBR125C 1182 nt5.46□□□□□ -1.54
USB1Q12208 LAG2YOL025W 1983 nt5.46□□□□□ -1.54
USB1Q12208 ASN1YPR145W 1719 nt5.45□□□□□ -1.54
USB1Q12208 YFL052WYFL052W 1398 nt5.45□□□□□ -1.54
USB1Q12208 IMA2YOL157C 1770 nt5.45□□□□□ -1.54
USB1Q12208 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.45□□□□□ -1.54
USB1Q12208 YLR312CYLR312C 1197 nt5.45□□□□□ -1.54
USB1Q12208 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.45□□□□□ -1.54
USB1Q12208 FPR3YML074C 1236 nt5.45□□□□□ -1.54
USB1Q12208 YMR252CYMR252C 405 nt5.45□□□□□ -1.54
USB1Q12208 YBL112CYBL112C 318 nt5.45□□□□□ -1.54
USB1Q12208 KTR1YOR099W 1182 nt5.45□□□□□ -1.54
USB1Q12208 YMR279CYMR279C 1623 nt5.45□□□□□ -1.54
USB1Q12208 KNS1YLL019C 2214 nt5.44□□□□□ -1.54
USB1Q12208 CUP2YGL166W 678 nt5.44□□□□□ -1.54
USB1Q12208 YLR184WYLR184W 348 nt5.44□□□□□ -1.54
USB1Q12208 SPS22YCL048W 1392 nt5.43□□□□□ -1.54
USB1Q12208 CMR1YDL156W 1569 nt5.43□□□□□ -1.54
USB1Q12208 PHO3YBR092C 1404 nt5.43□□□□□ -1.54
USB1Q12208 FPR2YDR519W 408 nt5.43□□□□□ -1.54
USB1Q12208 YIL077CYIL077C 963 nt5.43□□□□□ -1.54
USB1Q12208 MDH1YKL085W 1005 nt5.43□□□□□ -1.54
USB1Q12208 AAT2YLR027C 1257 nt5.43□□□□□ -1.54
USB1Q12208 PEX13YLR191W 1161 nt5.43□□□□□ -1.54
USB1Q12208 YMR122CYMR122C 375 nt5.43□□□□□ -1.54
USB1Q12208 IES2YNL215W 963 nt5.43□□□□□ -1.54
USB1Q12208 CRP1YHR146W 1398 nt5.42□□□□□ -1.54
USB1Q12208 GDA1YEL042W 1557 nt5.42□□□□□ -1.54
USB1Q12208 MSN2YMR037C 2115 nt5.42□□□□□ -1.54
USB1Q12208 TEL2YGR099W 2067 nt5.41□□□□□ -1.54
USB1Q12208 DUG1YFR044C 1446 nt5.41□□□□□ -1.54
USB1Q12208 ACS1YAL054C 2142 nt5.41□□□□□ -1.54
USB1Q12208 snR82snR82 268 nt5.41□□□□□ -1.54
USB1Q12208 TAE1YBR261C 699 nt5.41□□□□□ -1.54
USB1Q12208 SUB2YDL084W 1341 nt5.41□□□□□ -1.54
USB1Q12208 EXG1YLR300W 1347 nt5.41□□□□□ -1.54
USB1Q12208 CDC1YDR182W 1476 nt5.4□□□□□ -1.54
USB1Q12208 RAD59YDL059C 717 nt5.4□□□□□ -1.54
USB1Q12208 FYV1YDR024W 486 nt5.4□□□□□ -1.54
USB1Q12208 YDR187CYDR187C 519 nt5.4□□□□□ -1.54
USB1Q12208 RPS3YNL178W 723 nt5.4□□□□□ -1.54
USB1Q12208 YMC1YPR058W 924 nt5.4□□□□□ -1.54
USB1Q12208 SGF29YCL010C 780 nt5.4□□□□□ -1.54
USB1Q12208 GPT2YKR067W 2232 nt5.4□□□□□ -1.55
USB1Q12208 OSW2YLR054C 2175 nt5.39□□□□□ -1.55
USB1Q12208 VPS61YDR136C 573 nt5.39□□□□□ -1.55
USB1Q12208 TDH2YJR009C 999 nt5.39□□□□□ -1.55
USB1Q12208 BSC4YNL269W 396 nt5.39□□□□□ -1.55
USB1Q12208 TKL1YPR074C 2043 nt5.39□□□□□ -1.55
USB1Q12208 PGM1YKL127W 1713 nt5.39□□□□□ -1.55
USB1Q12208 AVT4YNL101W 2142 nt5.39□□□□□ -1.55
USB1Q12208 GLN3YER040W 2193 nt5.39□□□□□ -1.55
USB1Q12208 ARG81YML099C 2643 nt5.38□□□□□ -1.55
USB1Q12208 YLL067CYLL067C 3618 nt5.38□□□□□ -1.55
USB1Q12208 PAP2YOL115W 1755 nt5.38□□□□□ -1.55
USB1Q12208 GTT3YEL017W 1014 nt5.38□□□□□ -1.55
USB1Q12208 SKN1YGR143W 2316 nt5.38□□□□□ -1.55
USB1Q12208 BUG1YDL099W 1026 nt5.37□□□□□ -1.55
USB1Q12208 MRPL1YDR116C 858 nt5.37□□□□□ -1.55
USB1Q12208 MPC2YHR162W 390 nt5.37□□□□□ -1.55
USB1Q12208 YNL200CYNL200C 741 nt5.37□□□□□ -1.55
USB1Q12208 MOD5YOR274W 1287 nt5.37□□□□□ -1.55
USB1Q12208 CRF1YDR223W 1404 nt5.37□□□□□ -1.55
USB1Q12208 SKI2YLR398C 3864 nt5.37□□□□□ -1.55
USB1Q12208 ILV1YER086W 1731 nt5.37□□□□□ -1.55
USB1Q12208 RPL21AYBR191W 483 nt5.36□□□□□ -1.55
USB1Q12208 ATG22YCL038C 1587 nt5.36□□□□□ -1.55
USB1Q12208 AMD2YDR242W 1650 nt5.36□□□□□ -1.55
USB1Q12208 RRP9YPR137W 1722 nt5.36□□□□□ -1.55
USB1Q12208 VHT1YGR065C 1782 nt5.36□□□□□ -1.55
USB1Q12208 FAT3YKL187C 2253 nt5.36□□□□□ -1.55
USB1Q12208 HRQ1YDR291W 3234 nt5.35□□□□□ -1.55
USB1Q12208 SNU71YGR013W 1863 nt5.35□□□□□ -1.55
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