Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal1Q0VBP7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shisal1Q0VBP7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms