Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AmbpQ07456 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AmbpQ07456 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AmbpQ07456 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AmbpQ07456 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AmbpQ07456 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AmbpQ07456 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AmbpQ07456 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AmbpQ07456 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AmbpQ07456 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AmbpQ07456 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AmbpQ07456 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AmbpQ07456 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AmbpQ07456 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AmbpQ07456 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms