Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 POX1YGL205W 2247 nt5.8□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 MPA43YNL249C 1629 nt5.8□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 COX10YPL172C 1389 nt5.8□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 COX15YER141W 1461 nt5.79□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 YJR146WYJR146W 354 nt5.79□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 OCA1YNL099C 717 nt5.79□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 YBL070CYBL070C 321 nt5.79□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 COQ3YOL096C 939 nt5.79□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 SCO2YBR024W 906 nt5.79□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 PFK2YMR205C 2880 nt5.79□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 RGD1YBR260C 2001 nt5.79□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 FZF1YGL254W 900 nt5.78□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 AIM24YJR080C 1185 nt5.78□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 RKI1YOR095C 777 nt5.78□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 PDR18YNR070W 4002 nt5.77□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 PEX3YDR329C 1326 nt5.77□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 KTR5YNL029C 1569 nt5.77□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 THI4YGR144W 981 nt5.77□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 DMA1YHR115C 1251 nt5.77□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 YNL092WYNL092W 1203 nt5.77□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 YPL257WYPL257W 582 nt5.77□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 HOS2YGL194C 1359 nt5.77□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 COX9YDL067C 180 nt5.76□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 AGX1YFL030W 1158 nt5.76□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 HMT1YBR034C 1047 nt5.76□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 ASR1YPR093C 867 nt5.76□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 VHT1YGR065C 1782 nt5.75□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 CYS4YGR155W 1524 nt5.75□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 SRN2YLR119W 642 nt5.75□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 YML6YML025C 861 nt5.75□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 BSC4YNL269W 396 nt5.75□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 SIR2YDL042C 1689 nt5.75□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 MKK1YOR231W 1527 nt5.74□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 PGM1YKL127W 1713 nt5.74□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 YML133CYML133C 4125 nt5.74□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 AST1YBL069W 1290 nt5.74□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 HST2YPL015C 1074 nt5.74□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 YPR076WYPR076W 375 nt5.74□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 YGR054WYGR054W 1929 nt5.74□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 RSA4YCR072C 1548 nt5.74□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 PPH21YDL134C 1110 nt5.73□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 FAL1YDR021W 1200 nt5.73□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 PMP3YDR276C 168 nt5.73□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 YDR278CYDR278C 318 nt5.73□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 HOC1YJR075W 1191 nt5.73□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 YMR147WYMR147W 672 nt5.73□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 ATP4YPL078C 735 nt5.73□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 CRH1YGR189C 1524 nt5.73□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 RIX7YLL034C 2514 nt5.72□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 FMP40YPL222W 2067 nt5.72□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 MRPL1YDR116C 858 nt5.72□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt5.72□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 QCR8YJL166W 285 nt5.72□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 MDE1YJR024C 735 nt5.72□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 LIA1YJR070C 978 nt5.72□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 ICT1YLR099C 1185 nt5.72□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 PYC2YBR218C 3543 nt5.72□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 RMD9YGL107C 1941 nt5.72□□□□□ -1.49
SSK1Q07084 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.71□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 ARE2YNR019W 1929 nt5.71□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 SPS22YCL048W 1392 nt5.7□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 HRQ1YDR291W 3234 nt5.7□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 COA1YIL157C 594 nt5.7□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 RNH1YMR234W 1047 nt5.7□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 LDB16YCL005W 771 nt5.7□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 YDR514CYDR514C 1452 nt5.7□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 YHK8YHR048W 1545 nt5.69□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 SRY1YKL218C 981 nt5.69□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 CTF19YPL018W 1110 nt5.69□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 PXL1YKR090W 2121 nt5.69□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 EMW1YNL313C 2715 nt5.68□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 YHR140WYHR140W 720 nt5.68□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 YRB2YIL063C 984 nt5.68□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 CCP1YKR066C 1086 nt5.68□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 RUF23RUF23 254 nt5.68□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 IES2YNL215W 963 nt5.68□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 LSC1YOR142W 990 nt5.68□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 MRC1YCL061C 3291 nt5.68□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 CDS1YBR029C 1374 nt5.67□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 APM1YPL259C 1428 nt5.67□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 HXT17YNR072W 1695 nt5.67□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 HIS7YBR248C 1659 nt5.67□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 CDC10YCR002C 969 nt5.67□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 TRP1YDR007W 675 nt5.67□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 LYS1YIR034C 1122 nt5.67□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 YKL102CYKL102C 306 nt5.67□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 OAC1YKL120W 975 nt5.67□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 YPL071CYPL071C 471 nt5.67□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 ECM31YBR176W 939 nt5.67□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 TFC6YDR362C 2019 nt5.67□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 ESC8YOL017W 2145 nt5.66□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 YOL036WYOL036W 2286 nt5.66□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 GPD1YDL022W 1176 nt5.66□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 LCL3YGL085W 825 nt5.66□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 YIR042CYIR042C 711 nt5.66□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 SRL2YLR082C 1179 nt5.66□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 KTR1YOR099W 1182 nt5.66□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 CHS5YLR330W 2016 nt5.65□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.65□□□□□ -1.5
SSK1Q07084 LCB3YJL134W 1230 nt5.65□□□□□ -1.5
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