Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 YBL112CYBL112C 318 nt5.08□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 SGF29YCL010C 780 nt5.08□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 YOL036WYOL036W 2286 nt5.08□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 UBP13YBL067C 2244 nt5.08□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 PRP24YMR268C 1335 nt5.07□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 TFG2YGR005C 1203 nt5.07□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 POP5YAL033W 522 nt5.07□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 ICT1YLR099C 1185 nt5.07□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 FET4YMR319C 1659 nt5.07□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 YHL017WYHL017W 1599 nt5.07□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 PPT1YGR123C 1542 nt5.07□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 YDR514CYDR514C 1452 nt5.07□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 PTC3YBL056W 1407 nt5.06□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 RGD1YBR260C 2001 nt5.06□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 HAL5YJL165C 2568 nt5.06□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 COX9YDL067C 180 nt5.06□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.06□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.06□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 YMR252CYMR252C 405 nt5.06□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 YBR027CYBR027C 333 nt5.06□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 RGT2YDL138W 2292 nt5.06□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 HRQ1YDR291W 3234 nt5.05□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 EFM3YJR129C 1020 nt5.05□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 DRE2YKR071C 1047 nt5.05□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 FPR3YML074C 1236 nt5.05□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 OSW2YLR054C 2175 nt5.05□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 PRY3YJL078C 2646 nt5.05□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 TKL2YBR117C 2046 nt5.04□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 STB5YHR178W 2232 nt5.04□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 UIP5YKR044W 1332 nt5.04□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 BUG1YDL099W 1026 nt5.04□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 YMC1YPR058W 924 nt5.04□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 YCK1YHR135C 1617 nt5.04□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 ZWF1YNL241C 1518 nt5.03□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 MCH1YDL054C 1461 nt5.03□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 NOG2YNR053C 1461 nt5.03□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 YMR122CYMR122C 375 nt5.03□□□□□ -1.6
YHP1Q04116 CNE1YAL058W 1509 nt5.02□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 PGK1YCR012W 1251 nt5.02□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 YDR187CYDR187C 519 nt5.02□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 CUP2YGL166W 678 nt5.02□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 HGH1YGR187C 1185 nt5.02□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 SCS7YMR272C 1155 nt5.02□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 CDC1YDR182W 1476 nt5.01□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 EXG1YLR300W 1347 nt5.01□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 YGL235WYGL235W 537 nt5.01□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 OAC1YKL120W 975 nt5.01□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 RPS3YNL178W 723 nt5.01□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 TAE1YBR261C 699 nt5.01□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 PET112YBL080C 1626 nt5.01□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 GUD1YDL238C 1470 nt5□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 AIM3YBR108W 2844 nt5□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 TDH2YJR009C 999 nt5□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 YPR123CYPR123C 435 nt5□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 RRP9YPR137W 1722 nt5□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 PYK2YOR347C 1521 nt4.99□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 YIL055CYIL055C 1884 nt4.99□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 MRS1YIR021W 1092 nt4.99□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 ERP2YAL007C 648 nt4.99□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 GLC8YMR311C 690 nt4.99□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 ILV1YER086W 1731 nt4.99□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 HXT2YMR011W 1626 nt4.98□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 YMR279CYMR279C 1623 nt4.98□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 VPS5YOR069W 2028 nt4.98□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 FYV1YDR024W 486 nt4.98□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 YJR084WYJR084W 1272 nt4.98□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 IMD1YAR073W 1212 nt4.98□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 RIX7YLL034C 2514 nt4.97□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 MNN5YJL186W 1761 nt4.97□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 RAD59YDL059C 717 nt4.97□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 YOL163WYOL163W 510 nt4.97□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 YBR284WYBR284W 2394 nt4.97□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 TEP1YNL128W 1305 nt4.97□□□□□ -1.61
YHP1Q04116 SDH4YDR178W 546 nt4.96□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt4.96□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 YLR463CYLR463C 552 nt4.96□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 CYC8YBR112C 2901 nt4.96□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 GYP8YFL027C 1494 nt4.95□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 WHI2YOR043W 1461 nt4.95□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 RPN11YFR004W 921 nt4.95□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 SPG1YGR236C 288 nt4.95□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt4.95□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt4.95□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt4.95□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt4.95□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt4.95□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 MPC2YHR162W 390 nt4.95□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 RNH201YNL072W 924 nt4.95□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 ESC8YOL017W 2145 nt4.95□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 HDA1YNL021W 2121 nt4.94□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 YFL042CYFL042C 2025 nt4.94□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 KKQ8YKL168C 2175 nt4.94□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 RPT3YDR394W 1287 nt4.94□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 MSP1YGR028W 1089 nt4.94□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 YMR295CYMR295C 594 nt4.94□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 RPS28AYOR167C 204 nt4.94□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 FSF1YOR271C 984 nt4.94□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 VPS4YPR173C 1314 nt4.94□□□□□ -1.62
YHP1Q04116 FRS2YFL022C 1512 nt4.93□□□□□ -1.62
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