Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp9xP70398 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp9xP70398 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp9xP70398 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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