Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabra1P62812 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms