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Protein–RNA interactions for Protein: P53551
HHO1, Histone H1, yeast
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258 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
HHO1
P53551
YLL067C
YLL067C
3618 nt
5.27
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
YAP1801
YHR161C
1914 nt
5.27
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
TIM22
YDL217C
624 nt
5.27
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
MAL11
YGR289C
1851 nt
5.27
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
SWD1
YAR003W
1281 nt
5.27
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
ERI1
YPL096C-A
207 nt
5.27
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
MSI1
YBR195C
1269 nt
5.27
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
GAT1
YFL021W
1533 nt
5.27
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
COX10
YPL172C
1389 nt
5.27
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
EMW1
YNL313C
2715 nt
5.26
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
LYS1
YIR034C
1122 nt
5.26
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
DID2
YKR035W-A
615 nt
5.26
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
PFA3
YNL326C
1011 nt
5.26
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
YNR005C
YNR005C
405 nt
5.26
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
GEX1
YCL073C
1848 nt
5.25
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
GEX2
YKR106W
1848 nt
5.25
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
VCX1
YDL128W
1236 nt
5.25
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
TMT1
YER175C
900 nt
5.25
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
PRI1
YIR008C
1230 nt
5.25
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
POP5
YAL033W
522 nt
5.25
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
GET4
YOR164C
939 nt
5.25
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
YPL257W
YPL257W
582 nt
5.25
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
MNN2
YBR015C
1794 nt
5.24
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
DOT1
YDR440W
1749 nt
5.24
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
LDB16
YCL005W
771 nt
5.24
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
ODC2
YOR222W
924 nt
5.23
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
DAP1
YPL170W
459 nt
5.23
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
HIR1
YBL008W
2523 nt
5.23
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
TRP1
YDR007W
675 nt
5.22
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
ATP1
YBL099W
1638 nt
5.22
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
MSS1
YMR023C
1581 nt
5.21
□□□□□ -1.57
HHO1
P53551
RPT3
YDR394W
1287 nt
5.21
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
YLR162W
YLR162W
357 nt
5.21
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
YPR130C
YPR130C
408 nt
5.21
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
NTE1
YML059C
5040 nt
5.2
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
YHR070C-A
YHR070C-A
411 nt
5.2
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
MDE1
YJR024C
735 nt
5.2
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
YKL018C-A
YKL018C-A
300 nt
5.2
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
CLP1
YOR250C
1338 nt
5.2
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
RNR3
YIL066C
2610 nt
5.19
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
ICP55
YER078C
1536 nt
5.19
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
MRPL19
YNL185C
477 nt
5.19
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
HTZ1
YOL012C
405 nt
5.19
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
FSF1
YOR271C
984 nt
5.19
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
PGC1
YPL206C
966 nt
5.19
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
PDR18
YNR070W
4002 nt
5.19
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
IMA2
YOL157C
1770 nt
5.19
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
TAX4
YJL083W
1815 nt
5.18
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
IRS4
YKR019C
1848 nt
5.18
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
RFA1
YAR007C
1866 nt
5.18
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
YDR053W
YDR053W
396 nt
5.18
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
CIA1
YDR267C
993 nt
5.18
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
SIP2
YGL208W
1248 nt
5.18
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
YLL056C
YLL056C
897 nt
5.18
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
TAL1
YLR354C
1008 nt
5.18
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
ENT2
YLR206W
1842 nt
5.18
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
VBA1
YMR088C
1689 nt
5.18
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
TKL1
YPR074C
2043 nt
5.18
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
YTP1
YNL237W
1380 nt
5.17
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
ERC1
YHR032W
1746 nt
5.17
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
ASH1
YKL185W
1767 nt
5.17
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
YDL085C-A
YDL085C-A
207 nt
5.17
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
RRN3
YKL125W
1884 nt
5.17
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
FAL1
YDR021W
1200 nt
5.16
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
SNZ3
YFL059W
897 nt
5.16
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
SNZ2
YNL333W
897 nt
5.16
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
YPQ1
YOL092W
927 nt
5.16
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
MSC3
YLR219W
2187 nt
5.16
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
UBX2
YML013W
1755 nt
5.16
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
FAT3
YKL187C
2253 nt
5.16
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
MID1
YNL291C
1647 nt
5.15
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
DML1
YMR211W
1428 nt
5.15
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
SMF2
YHR050W
1650 nt
5.15
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
PDC1
YLR044C
1692 nt
5.15
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
HSF1
YGL073W
2502 nt
5.15
□□□□□ -1.58
HHO1
P53551
BUD32
YGR262C
786 nt
5.15
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
SUP2
tY(GUA)D
75 nt
5.15
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
SUP11
tY(GUA)F1
75 nt
5.15
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
SUP6
tY(GUA)F2
75 nt
5.15
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
SUP7
tY(GUA)J1
75 nt
5.15
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
SUP4
tY(GUA)J2
75 nt
5.15
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
SUP5
tY(GUA)M1
75 nt
5.15
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
SUP8
tY(GUA)M2
75 nt
5.15
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
SUP3
tY(GUA)O
75 nt
5.15
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
PRS1
YKL181W
1284 nt
5.15
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
SPG4
YMR107W
348 nt
5.15
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
YMR119W-A
YMR119W-A
375 nt
5.15
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
RUF23
RUF23
254 nt
5.15
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
YMC1
YPR058W
924 nt
5.15
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
ECM3
YOR092W
1842 nt
5.15
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
ASF2
YDL197C
1578 nt
5.15
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
EXG1
YLR300W
1347 nt
5.15
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
PKC1
YBL105C
3456 nt
5.15
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
YEH1
YLL012W
1722 nt
5.14
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
UBA1
YKL210W
3075 nt
5.14
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
SIA1
YOR137C
1869 nt
5.14
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
RPN11
YFR004W
921 nt
5.14
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
JIP4
YDR475C
2631 nt
5.14
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
FLC3
YGL139W
2409 nt
5.13
□□□□□ -1.59
HHO1
P53551
HPF1
YOL155C
2904 nt
5.13
□□□□□ -1.59
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