Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP1P50238 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CRIP1P50238 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms