Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab17P35292 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab17P35292 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab17P35292 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab17P35292 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab17P35292 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab17P35292 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
Rab17P35292 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab17P35292 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab17P35292 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab17P35292 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab17P35292 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab17P35292 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms