Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa1P35175 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stfa1P35175 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stfa1P35175 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms