Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 UIP4YPL186C 915 nt6.01□□□□□ -1.45
SEF1P34228 RPO26YPR187W 468 nt6.01□□□□□ -1.45
SEF1P34228 EFT2YDR385W 2529 nt6.01□□□□□ -1.45
SEF1P34228 EFT1YOR133W 2529 nt6.01□□□□□ -1.45
SEF1P34228 PAC2YER007W 1557 nt6.01□□□□□ -1.45
SEF1P34228 CYB2YML054C 1776 nt6.01□□□□□ -1.45
SEF1P34228 CEM1YER061C 1329 nt6□□□□□ -1.45
SEF1P34228 YIL055CYIL055C 1884 nt6□□□□□ -1.45
SEF1P34228 PAP1YKR002W 1707 nt6□□□□□ -1.45
SEF1P34228 MTR3YGR158C 753 nt6□□□□□ -1.45
SEF1P34228 ATG7YHR171W 1893 nt6□□□□□ -1.45
SEF1P34228 ECM38YLR299W 1983 nt6□□□□□ -1.45
SEF1P34228 YLL066CYLL066C 3618 nt6□□□□□ -1.45
SEF1P34228 VPS72YDR485C 2388 nt6□□□□□ -1.45
SEF1P34228 LYS21YDL131W 1323 nt5.99□□□□□ -1.45
SEF1P34228 PEX3YDR329C 1326 nt5.99□□□□□ -1.45
SEF1P34228 DOT1YDR440W 1749 nt5.99□□□□□ -1.45
SEF1P34228 CNM67YNL225C 1746 nt5.99□□□□□ -1.45
SEF1P34228 CDC10YCR002C 969 nt5.99□□□□□ -1.45
SEF1P34228 TRP1YDR007W 675 nt5.99□□□□□ -1.45
SEF1P34228 MRPL28YDR462W 444 nt5.99□□□□□ -1.45
SEF1P34228 NCS6YGL211W 1080 nt5.99□□□□□ -1.45
SEF1P34228 CBT1YKL208W 816 nt5.99□□□□□ -1.45
SEF1P34228 MRPL23YOR150W 492 nt5.99□□□□□ -1.45
SEF1P34228 PXL1YKR090W 2121 nt5.99□□□□□ -1.45
SEF1P34228 MCH2YKL221W 1422 nt5.99□□□□□ -1.45
SEF1P34228 HXT17YNR072W 1695 nt5.98□□□□□ -1.45
SEF1P34228 GSH1YJL101C 2037 nt5.98□□□□□ -1.45
SEF1P34228 YDL177CYDL177C 513 nt5.98□□□□□ -1.45
SEF1P34228 HED1YDR014W-A 489 nt5.98□□□□□ -1.45
SEF1P34228 THI4YGR144W 981 nt5.98□□□□□ -1.45
SEF1P34228 CBR1YIL043C 855 nt5.98□□□□□ -1.45
SEF1P34228 BNA5YLR231C 1362 nt5.97□□□□□ -1.45
SEF1P34228 SRP101YDR292C 1866 nt5.97□□□□□ -1.45
SEF1P34228 ACS1YAL054C 2142 nt5.97□□□□□ -1.45
SEF1P34228 ZRT2YLR130C 1269 nt5.97□□□□□ -1.45
SEF1P34228 RDL2YOR286W 450 nt5.97□□□□□ -1.45
SEF1P34228 ALT2YDR111C 1524 nt5.97□□□□□ -1.45
SEF1P34228 RIX7YLL034C 2514 nt5.97□□□□□ -1.45
SEF1P34228 PHO3YBR092C 1404 nt5.97□□□□□ -1.45
SEF1P34228 NTE1YML059C 5040 nt5.97□□□□□ -1.45
SEF1P34228 UIP5YKR044W 1332 nt5.97□□□□□ -1.45
SEF1P34228 YHR020WYHR020W 2067 nt5.96□□□□□ -1.46
SEF1P34228 JJJ3YJR097W 519 nt5.96□□□□□ -1.46
SEF1P34228 BDF2YDL070W 1917 nt5.95□□□□□ -1.46
SEF1P34228 IVY1YDR229W 1362 nt5.95□□□□□ -1.46
SEF1P34228 CHL4YDR254W 1377 nt5.95□□□□□ -1.46
SEF1P34228 COQ1YBR003W 1422 nt5.95□□□□□ -1.46
SEF1P34228 HBN1YCL026C-B 582 nt5.95□□□□□ -1.46
SEF1P34228 PET112YBL080C 1626 nt5.95□□□□□ -1.46
SEF1P34228 DSF1YEL070W 1509 nt5.94□□□□□ -1.46
SEF1P34228 YHK8YHR048W 1545 nt5.94□□□□□ -1.46
SEF1P34228 YNR073CYNR073C 1509 nt5.94□□□□□ -1.46
SEF1P34228 ARO10YDR380W 1908 nt5.94□□□□□ -1.46
SEF1P34228 ERP5YHR110W 639 nt5.94□□□□□ -1.46
SEF1P34228 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.94□□□□□ -1.46
SEF1P34228 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.94□□□□□ -1.46
SEF1P34228 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.94□□□□□ -1.46
SEF1P34228 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.94□□□□□ -1.46
SEF1P34228 YNL247WYNL247W 2304 nt5.94□□□□□ -1.46
SEF1P34228 TAH11YJR046W 1815 nt5.94□□□□□ -1.46
SEF1P34228 SLA2YNL243W 2907 nt5.94□□□□□ -1.46
SEF1P34228 PPM2YOL141W 2088 nt5.94□□□□□ -1.46
SEF1P34228 CDS1YBR029C 1374 nt5.93□□□□□ -1.46
SEF1P34228 YHL018WYHL018W 363 nt5.93□□□□□ -1.46
SEF1P34228 MPC2YHR162W 390 nt5.93□□□□□ -1.46
SEF1P34228 YRB2YIL063C 984 nt5.93□□□□□ -1.46
SEF1P34228 MOG1YJR074W 657 nt5.93□□□□□ -1.46
SEF1P34228 SEN34YAR008W 828 nt5.93□□□□□ -1.46
SEF1P34228 ARC35YNR035C 1029 nt5.93□□□□□ -1.46
SEF1P34228 COX10YPL172C 1389 nt5.93□□□□□ -1.46
SEF1P34228 ISC1YER019W 1434 nt5.92□□□□□ -1.46
SEF1P34228 ERS1YCR075C 783 nt5.92□□□□□ -1.46
SEF1P34228 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.92□□□□□ -1.46
SEF1P34228 SCS7YMR272C 1155 nt5.92□□□□□ -1.46
SEF1P34228 SGF29YCL010C 780 nt5.92□□□□□ -1.46
SEF1P34228 EMW1YNL313C 2715 nt5.92□□□□□ -1.46
SEF1P34228 AIM17YHL021C 1398 nt5.92□□□□□ -1.46
SEF1P34228 CCT3YJL014W 1605 nt5.92□□□□□ -1.46
SEF1P34228 ARP3YJR065C 1350 nt5.92□□□□□ -1.46
SEF1P34228 SNN1YNL086W 309 nt5.91□□□□□ -1.46
SEF1P34228 OCA1YNL099C 717 nt5.91□□□□□ -1.46
SEF1P34228 ECM2YBR065C 1095 nt5.91□□□□□ -1.46
SEF1P34228 OPI11YPR044C 354 nt5.91□□□□□ -1.46
SEF1P34228 RAP1YNL216W 2484 nt5.91□□□□□ -1.46
SEF1P34228 RGD2YFL047W 2145 nt5.9□□□□□ -1.46
SEF1P34228 RIO1YOR119C 1455 nt5.9□□□□□ -1.46
SEF1P34228 YBR241CYBR241C 1467 nt5.9□□□□□ -1.46
SEF1P34228 SIT1YEL065W 1887 nt5.9□□□□□ -1.46
SEF1P34228 PPH22YDL188C 1134 nt5.9□□□□□ -1.46
SEF1P34228 HSP12YFL014W 330 nt5.9□□□□□ -1.46
SEF1P34228 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.9□□□□□ -1.46
SEF1P34228 CCP1YKR066C 1086 nt5.9□□□□□ -1.46
SEF1P34228 YAR064WYAR064W 300 nt5.9□□□□□ -1.46
SEF1P34228 IRC11YOR013W 471 nt5.9□□□□□ -1.46
SEF1P34228 CCT8YJL008C 1707 nt5.9□□□□□ -1.47
SEF1P34228 GPA2YER020W 1350 nt5.9□□□□□ -1.47
SEF1P34228 VHT1YGR065C 1782 nt5.9□□□□□ -1.47
SEF1P34228 YGL072CYGL072C 360 nt5.89□□□□□ -1.47
SEF1P34228 YJU2YKL095W 837 nt5.89□□□□□ -1.47
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