Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TbpP29037 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TbpP29037 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TbpP29037 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TbpP29037 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TbpP29037 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TbpP29037 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TbpP29037 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TbpP29037 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TbpP29037 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TbpP29037 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TbpP29037 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TbpP29037 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TbpP29037 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TbpP29037 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TbpP29037 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TbpP29037 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TbpP29037 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TbpP29037 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TbpP29037 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TbpP29037 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TbpP29037 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TbpP29037 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TbpP29037 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TbpP29037 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TbpP29037 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TbpP29037 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TbpP29037 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TbpP29037 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TbpP29037 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TbpP29037 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TbpP29037 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TbpP29037 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TbpP29037 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TbpP29037 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TbpP29037 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TbpP29037 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TbpP29037 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TbpP29037 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TbpP29037 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TbpP29037 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TbpP29037 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TbpP29037 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TbpP29037 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TbpP29037 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TbpP29037 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TbpP29037 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TbpP29037 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TbpP29037 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TbpP29037 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TbpP29037 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TbpP29037 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TbpP29037 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TbpP29037 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TbpP29037 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TbpP29037 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TbpP29037 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TbpP29037 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TbpP29037 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TbpP29037 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TbpP29037 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TbpP29037 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TbpP29037 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TbpP29037 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TbpP29037 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TbpP29037 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TbpP29037 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TbpP29037 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TbpP29037 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TbpP29037 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TbpP29037 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TbpP29037 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TbpP29037 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TbpP29037 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TbpP29037 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TbpP29037 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TbpP29037 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TbpP29037 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TbpP29037 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TbpP29037 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TbpP29037 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TbpP29037 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TbpP29037 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TbpP29037 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TbpP29037 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TbpP29037 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TbpP29037 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TbpP29037 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TbpP29037 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TbpP29037 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TbpP29037 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TbpP29037 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TbpP29037 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TbpP29037 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TbpP29037 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TbpP29037 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TbpP29037 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TbpP29037 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TbpP29037 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TbpP29037 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms