Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT1P21579 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT1P21579 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT1P21579 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT1P21579 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT1P21579 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT1P21579 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT1P21579 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT1P21579 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYT1P21579 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYT1P21579 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYT1P21579 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYT1P21579 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYT1P21579 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SYT1P21579 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SYT1P21579 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYT1P21579 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYT1P21579 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYT1P21579 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYT1P21579 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYT1P21579 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYT1P21579 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYT1P21579 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYT1P21579 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYT1P21579 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYT1P21579 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYT1P21579 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYT1P21579 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYT1P21579 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYT1P21579 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYT1P21579 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYT1P21579 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYT1P21579 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYT1P21579 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYT1P21579 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYT1P21579 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SYT1P21579 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYT1P21579 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYT1P21579 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYT1P21579 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYT1P21579 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYT1P21579 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYT1P21579 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYT1P21579 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYT1P21579 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYT1P21579 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYT1P21579 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYT1P21579 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYT1P21579 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYT1P21579 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYT1P21579 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYT1P21579 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYT1P21579 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYT1P21579 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYT1P21579 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYT1P21579 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYT1P21579 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYT1P21579 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYT1P21579 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYT1P21579 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYT1P21579 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYT1P21579 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYT1P21579 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYT1P21579 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYT1P21579 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYT1P21579 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYT1P21579 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SYT1P21579 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYT1P21579 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYT1P21579 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYT1P21579 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYT1P21579 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYT1P21579 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT1P21579 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT1P21579 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT1P21579 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT1P21579 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT1P21579 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT1P21579 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT1P21579 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT1P21579 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT1P21579 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT1P21579 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT1P21579 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYT1P21579 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYT1P21579 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYT1P21579 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYT1P21579 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYT1P21579 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYT1P21579 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYT1P21579 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SYT1P21579 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SYT1P21579 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYT1P21579 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYT1P21579 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYT1P21579 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYT1P21579 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYT1P21579 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYT1P21579 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYT1P21579 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms