Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfi1bO70237 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gfi1bO70237 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfi1bO70237 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfi1bO70237 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfi1bO70237 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfi1bO70237 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfi1bO70237 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfi1bO70237 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1bO70237 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1bO70237 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfi1bO70237 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfi1bO70237 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfi1bO70237 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfi1bO70237 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfi1bO70237 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms