Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SYNGR2O43760 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYNGR2O43760 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms